Molecular assessment of Pocillopora verrucosa (Scleractinia; Pocilloporidae) distribution along a depth gradient in Ludao, Taiwan
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石珊瑚的分類是根據其骨骼特徵，但此特徵會隨著生存環境而變化，這使得生物學家在鑑定珊瑚種類時充滿挑戰，所以當沿著深度梯度研究珊瑚時，因為光照及水團特性的不同會造成珊瑚的形態改變，使得分類變得更加艱鉅。台灣對於淺水區 (深度<10m) 疣狀杯型珊瑚 [Pocillopora verrucosa (Ellis and Solander, 1786)] 的研究已有相關報告，但近期的研究觀察對此物種在中光層 (深度>40m) 的水深分佈有疑問。本所單偉彌老師及中研院的學者利用分子的方法調查綠島周邊疣狀杯型珊瑚的垂直及水平空間分佈，他們在綠島周邊海域找了三個樣點，由水深7-45米的範圍，取4個深度採集似疣狀杯型珊瑚的珊瑚株，對粒線體的開啟讀碼框 (mtORF-ATP6) 和組蛋白3 (Hist3) 進行基因分型。結果採樣的101個樣本中，有85個屬於P. verrucosa，15個為 P. meandrina，1個則是未描述的Pocillopora物種，發現Pocillopora在台灣的實際分布深度較已知深度為深，並說明P. verrucosa可將中光層作為其生存的避難所。研究指出野外鑑定Pocillopora的難處，並強調欲釐清物種之垂直及水平分佈，分子分類學與傳統型態分類學相輔相成。單老師也指出保育生物學應著重在物種基因多樣性而非物種多樣性。本論文標題Molecular assessment of Pocillopora verrucosa (Scleractinia; Pocilloporidae) distribution along a depth gradient in Ludao, Taiwan”，為台大及中央研究院共同合作，發表在2018年10月期刊PeerJ，研究成果有助了解台灣中光層珊瑚礁生態系在未來自然及人為干擾下所扮演的角色。
(單偉彌Vianney Denis)
Reference: De Palmas S, Soto D, Denis V*, Ho M, Chen CA* (2018) Molecular assessment of Pocillopora verrucosa (Scleractinia; Pocilloporidae) distribution along a depth gradient in Ludao, Taiwan. PeerJ 6:e5797 https://doi.org/10.7717/peerj.5797
Figure legend: Haplotype network based on the mtORF sequences data (total alignment length 656 bp). Vertical bars represent the number of base pair differences between haplotype. Pocillopora clade 2 is blue, Pocillopora type 8 is brown, Pocillopora clade 3 is red.